183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0609 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  598  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  29.39 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  24.16 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  29.57 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  24.75 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  26.16 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  24.74 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  23.16 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  23.47 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  23.86 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  24.48 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.6 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  26.4 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  24.57 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  24.5 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  23.63 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  25.17 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  23.43 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  22.11 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  24.83 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  22.11 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  24.83 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  24.16 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  24.83 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  24.16 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  22.11 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  24.12 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  24.83 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  25.41 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  26.41 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  29.2 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4791  hypothetical protein  26.09 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00231071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4813  exported membrane protein  26.09 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000948191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4673  exported membrane protein  26.09 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000162371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  30.24 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4663  exported membrane protein  26.09 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00303431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  23.76 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4755  exported membrane protein  26.09 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000669886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  23.1 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.74 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  23.75 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  27.74 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  27.74 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  23.1 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  25.09 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  26.18 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.5 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  22.59 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  25.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  25.89 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  26.12 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.37 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  28.28 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.37 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.37 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.37 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  22.22 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  23.05 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  25.8 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  23.95 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.55 
 
 		 286 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  22.22 
 
 		 272 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  22.22 
 
 		 272 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.43 
 
 		 343 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  34.31 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  25.8 
 
 		 293 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  25.8 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  21.91 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  20.68 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  23.08 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  25.82 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.57 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1657  hypothetical protein  25.1 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  32.61 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  32.61 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1548  integral membrane protein  25.1 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.41 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  22.83 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.47 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  23.33 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  23 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 		 290 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  25.63 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4847  transporter, EamA family  21.8 
 
 		 316 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  25.38 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  20.88 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  21.86 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.32 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  22.47 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>