297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1076 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  62.71 
 
 
321 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  65.23 
 
 
313 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  54.85 
 
 
315 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  56.44 
 
 
308 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  56.44 
 
 
308 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  56.11 
 
 
308 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  53.31 
 
 
303 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  52.98 
 
 
303 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  50.51 
 
 
301 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  50.17 
 
 
310 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  56.25 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.97 
 
 
301 aa  252  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.97 
 
 
301 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  47.28 
 
 
301 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  50 
 
 
330 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  52 
 
 
314 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  44.08 
 
 
307 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.65 
 
 
311 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  49.15 
 
 
303 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  47.78 
 
 
301 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  50.51 
 
 
311 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  47.3 
 
 
426 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  50.17 
 
 
311 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  50.17 
 
 
311 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  50.17 
 
 
311 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  47.97 
 
 
376 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  47.97 
 
 
312 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  47.64 
 
 
312 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  45.89 
 
 
314 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  45.89 
 
 
314 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  49.82 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  42.71 
 
 
315 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  42.14 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  41.24 
 
 
304 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 
293 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  46.23 
 
 
312 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.92 
 
 
307 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  41.7 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  47.72 
 
 
272 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  47.72 
 
 
272 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  37.46 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.67 
 
 
299 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  43.64 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  42.14 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  40.71 
 
 
299 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  33.11 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  32.65 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  33.58 
 
 
297 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  36.07 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  32.21 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  26.53 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  29.43 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  22.04 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.99 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  33.5 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 
314 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33 
 
 
299 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.06 
 
 
299 aa  62.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  28.37 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 
305 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  28.37 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  33.82 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 
315 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  28.47 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.27 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.95 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.21 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  26.33 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.21 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  36.26 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  29.17 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.21 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  24.21 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.39 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  28.37 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  27.21 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  27.87 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.54 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  24.82 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  26.71 
 
 
295 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.25 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  27.92 
 
 
311 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  26.15 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.21 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.18 
 
 
300 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>