More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  99.34 
 
 		 303 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  72.19 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  69.97 
 
 		 308 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  70.3 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  69.64 
 
 		 308 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  71.52 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  70.47 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.79 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.79 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  53.95 
 
 		 301 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  51.95 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  50.17 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  52.22 
 
 		 301 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  55.15 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  53.2 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.19 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  52.3 
 
 		 304 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  49.51 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  51.2 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  51.18 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  50.51 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  51.18 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  49.14 
 
 		 307 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  50.84 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  49.51 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  49.51 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  49.19 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  49.19 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  49.49 
 
 		 311 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  49.32 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  51.84 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  51.84 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  44.21 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  43.15 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  42.07 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.52 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.64 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.47 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  42.62 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  42.37 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  42.03 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  41.55 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  40.49 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  44.23 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  43.12 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  34.36 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  34.13 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  34.18 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  35.42 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  36.2 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  29.04 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  24.27 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.77 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.9 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  31.6 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  29.57 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.21 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  28.72 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.92 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  28.62 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3828  hypothetical protein  31.19 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.795304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  23.26 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  29.05 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.86 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  25.26 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.25 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  29.25 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.75 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  29.89 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  25.09 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.51 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  26.19 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  26.97 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  26.22 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  23.83 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  26.77 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.51 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.68 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  25.79 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  31.71 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  25.79 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>