269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2587 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  100 
 
 		 298 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  55.25 
 
 		 313 aa  331  8e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  59.11 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  59.46 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  41.69 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  39.7 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  36.4 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  37.71 
 
 		 296 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2967  hypothetical protein  37.64 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105288  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  34 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  25.18 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  25.18 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  25.18 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  25.18 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  25.18 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  25.18 
 
 		 414 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  24.82 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  25.18 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  24.33 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  24.33 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  24.33 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  27.42 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  26.23 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  24.15 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  24.58 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  24.15 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  24.15 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  22.46 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.19 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  29.21 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  27.67 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  24.13 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  22.46 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  28.28 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  22.1 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  26.13 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  25.17 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  25.18 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.04 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  25.93 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23.59 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  25.26 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.76 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.76 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.83 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  26.84 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  24.44 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  24.92 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  24.47 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.44 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  23.36 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.58 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.3 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  25.69 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  25.69 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  26.69 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  23.91 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  24.06 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  25.74 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  23.44 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  27.09 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  25.63 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  26.42 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  25.68 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  26.52 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.52 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 308 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  23.13 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.6 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.72 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  21.74 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  23.24 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  23.19 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  25.61 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  26.33 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.32 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  25.18 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  22.64 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>