248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6618 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 303 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  53.26 
 
 		 301 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  51.04 
 
 		 298 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.14 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.46 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  50.34 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.8 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  46.44 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  49.65 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  48.63 
 
 		 414 aa  241  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  51.38 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  49.48 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  46.9 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  49.48 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  52.78 
 
 		 300 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.97 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.14 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  49.48 
 
 		 296 aa  235  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  47.26 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  46.83 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  46.92 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  46.92 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  50 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  50.17 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  46.58 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  46.58 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  46.58 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  46.58 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  43.15 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  43.15 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  42.81 
 
 		 303 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  50.38 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  51 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  50.38 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  50.38 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  49.48 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  48.96 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  49.15 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.1 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  41.92 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  43.34 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  41.11 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  41.7 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  40.07 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  41.32 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  35.71 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  34.56 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  34.34 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  37.83 
 
 		 284 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  29.6 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  35.05 
 
 		 319 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  34.33 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  32.58 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  29.39 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  30.27 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  26.2 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  27.17 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.17 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.07 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  27.59 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  23.55 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  27.05 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  28.33 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  25.19 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  26.72 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.73 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  26.03 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  28.29 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  25.19 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.84 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  26.94 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  24.25 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  26.94 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  27 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  26.51 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  26.51 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  24.51 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  26.07 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  26.07 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  25.5 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.9 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  26.53 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  26.71 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  25.56 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  25.56 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  25.91 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  25.62 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  26.53 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  27.46 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  26.53 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>