168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2336 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  67.13 
 
 		 298 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.25 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.94 
 
 		 298 aa  345  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.98 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  49.83 
 
 		 300 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  51.39 
 
 		 300 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  50.52 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.31 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  50.87 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  50.87 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  51.39 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  51.21 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  51.74 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  51.75 
 
 		 300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.96 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.37 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  45.18 
 
 		 304 aa  238  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  47.55 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  47.55 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  51.56 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  47.55 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.65 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  43.66 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  43.66 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  43.66 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  44.9 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  42.2 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.9 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  45.1 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  45.1 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.31 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  45.1 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  45.1 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  45.42 
 
 		 414 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  45.1 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  45.1 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  45.1 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  44.29 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  45.05 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  47.2 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  47.2 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  47.2 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  43.25 
 
 		 309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  46.15 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  44.64 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  39.58 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.39 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  36.18 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  42.47 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  34 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  33.68 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  32.2 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  29.92 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  31.03 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  29.29 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  26.76 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  24.71 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  27.55 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  28.45 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.32 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  28.62 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  25.09 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  27.42 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  25.57 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  24.91 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  24.91 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  28.25 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  24.83 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  28.84 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  26.57 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  26.5 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.67 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  25.26 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  24.83 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.48 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.47 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  23.43 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  22.77 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  23.47 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  23.47 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.05 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.91 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.05 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  26.47 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  23.47 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  23.83 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  28.35 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  24.05 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  24.42 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>