196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4613 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  47.08 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  43.06 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  42.61 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  41 
 
 		 300 aa  231  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  44.29 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.51 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  43.99 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.25 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  44.76 
 
 		 300 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.11 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  43.9 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  45.23 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  40.97 
 
 		 308 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  44.49 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  38.52 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.83 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  38.52 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  40.28 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  38.52 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  38.52 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  38.52 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  38.52 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  38.52 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  45.1 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  37.58 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  44.25 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  46.9 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  39.32 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  44.76 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  44.25 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  38.52 
 
 		 414 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  44.95 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.36 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  39.22 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  39.22 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.22 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  36.7 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  37.72 
 
 		 303 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  33.45 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  37.01 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.88 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  37.01 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  38.14 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  38.87 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  38.87 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  38.87 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  38.87 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  32.64 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.15 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  30.51 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  30.15 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  28.42 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  27.42 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  22.95 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25.09 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  24.16 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.56 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.37 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.56 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  25.09 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.82 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.26 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  23.63 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  28.28 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.39 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  28.28 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  25.37 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  25.37 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  21.36 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  24.92 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  23.46 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  25.2 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  26.27 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 335 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  27.7 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  21.8 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  26.85 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.29 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  27.03 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  27.03 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0476  transporter, EamA family  24.92 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  25.08 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 340 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  28.41 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  21.68 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>