244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0934 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  83.28 
 
 		 300 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  86.46 
 
 		 300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  84.3 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  78.33 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  85.81 
 
 		 298 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  79.25 
 
 		 301 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  78.67 
 
 		 300 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  76.92 
 
 		 300 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  77.93 
 
 		 300 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  57.19 
 
 		 414 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  57.39 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  57.19 
 
 		 395 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  57.19 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  57.19 
 
 		 296 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  56.84 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  56.84 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  56.84 
 
 		 296 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  56.84 
 
 		 316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  58.08 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  58.08 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  57.79 
 
 		 299 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  59.25 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  58.08 
 
 		 296 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  57.39 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  58.08 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  58.08 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.68 
 
 		 298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.52 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.68 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.21 
 
 		 299 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  50.17 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.43 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  51.21 
 
 		 301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.06 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  46.74 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.53 
 
 		 292 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  45.58 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  45.58 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  46.69 
 
 		 304 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.41 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  45.23 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.52 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  47.04 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  41.2 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  43.4 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  38.19 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  40.36 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  41.64 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  34.97 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  31.29 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  33.57 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  33.8 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  27.67 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  31.91 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  27.84 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  28.77 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  28.16 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  27.7 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  27.69 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  25.61 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  26.05 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.02 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  24.68 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  31.48 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.25 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  26.64 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  23.91 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.03 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  25.77 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  25.33 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  29.33 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.45 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  26.06 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  26.06 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  26.06 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  28.04 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  26.06 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  23.02 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  26.45 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  26.06 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  26.06 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  28.79 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>