276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2233 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  76.07 
 
 		 311 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  70.13 
 
 		 313 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  59.11 
 
 		 298 aa  340  2.9999999999999998e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  40.41 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  38.36 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  36 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  39.16 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  37.41 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2967  hypothetical protein  35.44 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  27.95 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  27.66 
 
 		 395 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  28.42 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  28.42 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  28.42 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  28.42 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.87 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  27.76 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  25.66 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  28.06 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  28.06 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  24.49 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  24.49 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  27.82 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  24.33 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  25.1 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  25.1 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  24.71 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  28.36 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  27.65 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  25.96 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.46 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  24.83 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  26.52 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.52 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.8 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  22.87 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.45 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  22.53 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  25.48 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  22.41 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  29.17 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  27.61 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  23.03 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  26.88 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  27.78 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  27.78 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.11 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  26.38 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  25.16 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  24.35 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  21.94 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  27.4 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  27.99 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.78 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.78 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  22.67 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.78 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  24.84 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.78 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  26.44 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  24.23 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  26.94 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  29.43 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  28.19 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  25.68 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  26.27 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  28.24 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.24 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.91 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  28.23 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  27.24 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  28.08 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  28.21 
 
 		 301 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  24.83 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.22 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  27.65 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  24.83 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  27.95 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  27.3 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  25.91 
 
 		 335 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>