242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1197 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
303 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  98.68 
 
 
303 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  98.68 
 
 
303 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  98.35 
 
 
303 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  65.26 
 
 
309 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  44.22 
 
 
298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.96 
 
 
298 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.83 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.86 
 
 
298 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 
299 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  43.31 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  39.6 
 
 
304 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  44.59 
 
 
301 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  44.14 
 
 
296 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  43.06 
 
 
300 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  43.46 
 
 
300 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  45.07 
 
 
298 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 
303 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  44.88 
 
 
300 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.2 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  45.23 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  45.39 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  42.07 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  42.07 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  42.07 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  43.92 
 
 
300 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  42.81 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  42.07 
 
 
296 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  42.81 
 
 
298 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  42.07 
 
 
296 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  42.07 
 
 
296 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  42.07 
 
 
316 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  41.11 
 
 
414 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  40.14 
 
 
299 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.44 
 
 
299 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 
292 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  43.06 
 
 
300 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  45.23 
 
 
300 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  43.23 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  39.27 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  36.36 
 
 
301 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  36.88 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  40.75 
 
 
284 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  35.21 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  36.84 
 
 
308 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  32.77 
 
 
293 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 
295 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  29.39 
 
 
300 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  28.62 
 
 
298 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  31.58 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  28.1 
 
 
301 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  28.42 
 
 
307 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.99 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.63 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  22.83 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  27.13 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.85 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.69 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  24.6 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  27.2 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.44 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.62 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.62 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.31 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  26.92 
 
 
296 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.13 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  23.18 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.62 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  26.36 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  23.81 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.17 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  23.84 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.21 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 
309 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  25.4 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  23.75 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  25.4 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  20.89 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  23.08 
 
 
313 aa  55.8  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  23.79 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  22.46 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  24.74 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.9 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  30.9 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  30.9 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.92 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  30.73 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  30.9 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  22.62 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  30.73 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  30.9 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  24.22 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  23.59 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>