255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2094 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  619  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  66.32 
 
 		 303 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  65.61 
 
 		 303 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  65.61 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.26 
 
 		 303 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.79 
 
 		 298 aa  231  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  45.14 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  45.02 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  46.58 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.4 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  46.74 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  41.18 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  45.94 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  42.56 
 
 		 414 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  43.6 
 
 		 299 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  43.25 
 
 		 301 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  45.83 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.81 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  41.87 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  42.01 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  42.01 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  42.21 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  45.49 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  46.29 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  42.01 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  42.01 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  42.01 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  42.01 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  41.05 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  41.32 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  41.32 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  46.23 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  44.83 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  42.65 
 
 		 296 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  42.65 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  42.65 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  42.65 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  41.24 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.28 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.11 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  38.14 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  34.17 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  35.29 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 295 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  33.81 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  32.51 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  35.34 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  31.47 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  28.97 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  30.12 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  32.13 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  25.27 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  26.33 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.68 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  24.11 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.68 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  24.06 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  26.56 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.1 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.67 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  24.75 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25.64 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.78 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  23.81 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  25.84 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  21.3 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  24.74 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  23.78 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.57 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  26.05 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  25.19 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.21 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  26.63 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  23.91 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  23.87 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  25.58 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.37 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.8 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  24.81 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  22.84 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.7 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>