More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4259 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  82.27 
 
 		 299 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  80.27 
 
 		 414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  80.2 
 
 		 298 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  80.2 
 
 		 298 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  78.57 
 
 		 395 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  78.57 
 
 		 296 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  78.57 
 
 		 296 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  78.23 
 
 		 296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  78.23 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  78.23 
 
 		 296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  78.23 
 
 		 296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  81.97 
 
 		 296 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  81.97 
 
 		 296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  82.31 
 
 		 296 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  82.31 
 
 		 296 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  80.27 
 
 		 296 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  53.68 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  55.44 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  55.44 
 
 		 301 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  54.39 
 
 		 300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  54.04 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  55.09 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  54.33 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  57.79 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  54.39 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  52.98 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  54.33 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.57 
 
 		 300 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.06 
 
 		 300 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.61 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.55 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  45.05 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.15 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  43.6 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.88 
 
 		 303 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  46.82 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  45.02 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  40.48 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  43.16 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  40.48 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  40.48 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  38.46 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  40.79 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  37.54 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  40.34 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  40.43 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.57 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  35.15 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  41.15 
 
 		 284 aa  145  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  38.06 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  35.09 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  27.21 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  31.79 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 		 367 aa  86.3  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  24.56 
 
 		 321 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  25.67 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  27.68 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.89 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  30.15 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  26.32 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.16 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  26.8 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  31.23 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  25.57 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  24.55 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  25.9 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.32 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  32.94 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.54 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  26.37 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  27.8 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  30.51 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.52 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  26.13 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  24.58 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.92 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3775  hypothetical protein  25.89 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  20.49 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  29.3 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  26.03 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  26.03 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  25.73 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  25.73 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  28.89 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  20.49 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  28.03 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  22.05 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>