151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4205 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  594  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  42.21 
 
 
304 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  42.55 
 
 
395 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  42.76 
 
 
414 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  42.55 
 
 
296 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.57 
 
 
298 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  42.55 
 
 
296 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  42.55 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  42.55 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  42.55 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  38.41 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  42.55 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  41.5 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  39.31 
 
 
301 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  41.13 
 
 
298 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  41.13 
 
 
298 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  37.85 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  38.75 
 
 
300 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  40.43 
 
 
299 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  36.18 
 
 
301 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 
298 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  38.19 
 
 
300 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  41.49 
 
 
296 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  38.38 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  37.72 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  41.13 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  40.98 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  40.98 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.14 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  38.25 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  37.28 
 
 
300 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  37.15 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  37.54 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  37.19 
 
 
303 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  35.42 
 
 
298 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  37.19 
 
 
303 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 
303 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  35.29 
 
 
309 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  32.64 
 
 
309 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.33 
 
 
299 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  37.85 
 
 
300 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  38.23 
 
 
308 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.74 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  40.98 
 
 
284 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.68 
 
 
292 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  35.46 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.68 
 
 
300 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  28.11 
 
 
300 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  34.62 
 
 
301 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  35.53 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  31.83 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  26.79 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  26.88 
 
 
301 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  31.03 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.1 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 
367 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  26.17 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.17 
 
 
343 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  27.97 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3422  hypothetical protein  34.14 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  26.85 
 
 
321 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  27.95 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  27.3 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  27.3 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  22.99 
 
 
317 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.3 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.3 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.3 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.3 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  32.97 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  24.91 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.12 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  26.02 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.85 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  26.79 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  26.79 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  24.52 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  24.67 
 
 
324 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  25.68 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  28.83 
 
 
292 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.16 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.72 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  32.07 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  27.54 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  29.15 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>