More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4763 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 314 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  50.88 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  50.55 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  51.07 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  45.8 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.31 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.38 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  49.62 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.93 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  41.79 
 
 		 324 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  46.34 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  49.8 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 290 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  44.73 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  46.98 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  44.73 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  43.37 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  43.26 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  44.64 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.13 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  46.03 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  46.62 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.45 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  42.05 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.35 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.63 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.39 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  49.29 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.15 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  37.12 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  36.36 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  36.36 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.98 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  35.98 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  37.55 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  37.16 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  37.16 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  36.78 
 
 		 284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.31 
 
 		 362 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  30.88 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  30.3 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  29.04 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  30.3 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  30.1 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  30.71 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 367 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  28.76 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  28.76 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  27.31 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.78 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  28.88 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  28.14 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  25.26 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  29.27 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  30.47 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  28.14 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  26.78 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  29.24 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  29.7 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.68 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  28.62 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.45 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.36 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  30.04 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.82 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.79 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.34 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  37.61 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  31.43 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.91 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  29.69 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.36 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  23.42 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  22.02 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.08 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.5 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  23.27 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  26.79 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.49 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  28.46 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  30.18 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.98 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  26.96 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.03 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.03 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  24.24 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  26.71 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>