283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0070 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 		 288 aa  560  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.83 
 
 		 290 aa  418  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.38 
 
 		 314 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  48.31 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  44.52 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  44.52 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  47.78 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  46.35 
 
 		 291 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  42.35 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  42.81 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  43.37 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  47.39 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  41.57 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.79 
 
 		 290 aa  195  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  42.16 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.39 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  42.97 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.55 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.3 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  43.45 
 
 		 395 aa  175  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  42.06 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.33 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  37.14 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  44.49 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 		 302 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  35.32 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  45.75 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  33.59 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  33.59 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  32.82 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  32.05 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  31.66 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  31.66 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.94 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  31.66 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  30.39 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  28.82 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  29.03 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  31.37 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  28.14 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  28.2 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  28.2 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  21.9 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  26.98 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  26.98 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  26.98 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.01 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  27.39 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  33.59 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.35 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  26.32 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  25.8 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.54 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  23.53 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.91 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.29 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  28.96 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  26.81 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  21.88 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.54 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  25.7 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  27.54 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  25.55 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  25.7 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  25.7 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.09 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.44 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.44 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  27.68 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  25.74 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.78 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.78 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.78 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  23.29 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.32 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  37.39 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.71 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.78 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  25.7 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  22.95 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  25.7 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  25.7 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  25.7 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  24.88 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>