296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3677 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
285 aa  544  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  45.95 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  41.11 
 
 
293 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  42.01 
 
 
318 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 
362 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.64 
 
 
314 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  37.87 
 
 
294 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  37.87 
 
 
294 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  41.27 
 
 
291 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.14 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 
290 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  36.75 
 
 
290 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  36.9 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  38.04 
 
 
299 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  35.32 
 
 
291 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  36.07 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  35.42 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  34.04 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  37.27 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  36.4 
 
 
318 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  35.85 
 
 
288 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.62 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 
291 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  37.07 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.84 
 
 
290 aa  125  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  40.24 
 
 
310 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.31 
 
 
301 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  32.16 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.76 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  31.76 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  31.76 
 
 
285 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  31.76 
 
 
285 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.03 
 
 
303 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  33.33 
 
 
284 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  32.94 
 
 
284 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.3 
 
 
302 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  32.94 
 
 
284 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  32.94 
 
 
284 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  37.89 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.47 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  31.01 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  28.52 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.05 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  26.47 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.19 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  27.72 
 
 
299 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  35.91 
 
 
294 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.88 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  25.36 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  29.58 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  30.34 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  25.42 
 
 
298 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.88 
 
 
298 aa  59.3  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  29.63 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.34 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  26.4 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  29.89 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  25.27 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  29.69 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  24.24 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  23.6 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  28.12 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  28.21 
 
 
319 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  26.07 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  23.6 
 
 
291 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  25.86 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.62 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  26.6 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.68 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  24.55 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  26.26 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  24.54 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.54 
 
 
301 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  27.08 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  24.54 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  24.91 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  24.19 
 
 
303 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  26.52 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.54 
 
 
301 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24.54 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  24.54 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24.54 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.73 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24.54 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>