284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0584 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  100 
 
 
313 aa  598  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  77.38 
 
 
322 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  62.75 
 
 
316 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  62.42 
 
 
316 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  65.69 
 
 
319 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  58.69 
 
 
313 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  58.28 
 
 
317 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  58.03 
 
 
313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  57.05 
 
 
313 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  57.7 
 
 
313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.18 
 
 
349 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  46.53 
 
 
336 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  45.12 
 
 
364 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  47.54 
 
 
356 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.36 
 
 
340 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.36 
 
 
340 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.74 
 
 
335 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  42.95 
 
 
300 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  28.04 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.58 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  31.06 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  23.42 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  24.83 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  28.89 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  28.67 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.95 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  23.05 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  23.05 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  23.05 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  23.05 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.05 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.88 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  23.05 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  23.42 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  23.42 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  24.52 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.41 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.41 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  32.32 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.05 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  32.34 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  23.33 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  29.43 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.08 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  25.29 
 
 
287 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  25.79 
 
 
300 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  26.4 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.96 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  26.4 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.12 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  29.52 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  30.94 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  26.8 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  24.89 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  23.51 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
348 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  27.27 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.89 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.19 
 
 
304 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  28.82 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  24.46 
 
 
293 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  23.28 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  23.28 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  22.77 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  27.57 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  22.77 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  22.77 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  22.77 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  24.3 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  30.3 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  26.06 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  24.84 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  23.91 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.02 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  27.88 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.99 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  24.02 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  24.02 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  24.02 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  24.02 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  27.88 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  22.98 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  24.03 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
290 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 
293 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>