More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3106 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  77.35 
 
 		 290 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.52 
 
 		 290 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.45 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  79.09 
 
 		 290 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  51.07 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  51.07 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  49.82 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  50.74 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  44.52 
 
 		 324 aa  228  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  55.88 
 
 		 395 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  46.69 
 
 		 293 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  48 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  45.71 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  52.96 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.26 
 
 		 314 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  50.18 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.03 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  43.37 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.76 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.38 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  44.22 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.74 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  49.61 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  45.25 
 
 		 346 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  40.08 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.72 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  49.62 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.42 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  35.66 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  35.66 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  35.66 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.53 
 
 		 362 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  34.88 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  37.66 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  37.66 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  35.83 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  37.24 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  30.5 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  28.41 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  29.59 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  30.11 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  28.78 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  32.22 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  29.89 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  30.86 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  32.42 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  29.93 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  30.93 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  29.46 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  30.63 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.23 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  30.63 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.46 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  28.28 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.29 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  28.33 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.72 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  26.13 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  26.69 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  27.12 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  26.41 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  28.09 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  29.7 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  32.87 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  28.42 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  27.72 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  26.3 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  29.29 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  25.75 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  25.18 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  31.64 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  27.98 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  30.19 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  26.92 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  32.32 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>