More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3933 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  99.3 
 
 		 284 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  99.3 
 
 		 284 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  93.59 
 
 		 285 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  93.95 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  93.95 
 
 		 285 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  97.18 
 
 		 284 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  92.53 
 
 		 285 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  92.17 
 
 		 285 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.24 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  38.4 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  38.17 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  40.07 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  37.22 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  36.26 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  36.26 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  37.01 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  34.96 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.34 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.59 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  32.52 
 
 		 298 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.28 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  35.23 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.73 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  35.29 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  31 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.22 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  30.58 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  40.8 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.68 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.32 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  36.29 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  35.04 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  32.36 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  29.93 
 
 		 291 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  32.7 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  36.26 
 
 		 395 aa  98.6  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  33.56 
 
 		 294 aa  95.5  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  35.59 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  30.56 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 		 362 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30.91 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.91 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.91 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  29.27 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.91 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.28 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  28.18 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.19 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.57 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.14 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  23.23 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  22.9 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  27.4 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.91 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  28.15 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  26.99 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  28.52 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  28.01 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  28.83 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  29.2 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  27.46 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  27.46 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  27.46 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  27.46 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.47 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  27.46 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  27.46 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  27.46 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.74 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  25.18 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  27.44 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  28.83 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  27.5 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  29.66 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  28.67 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  28.83 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  27.7 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  26.52 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.5 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.49 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  28.5 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  28.5 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  28.5 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  28.5 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  30.56 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  27.74 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>