177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24730 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  100 
 
 
356 aa  671    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.48 
 
 
341 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  41.62 
 
 
357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.32 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  45.6 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  46.38 
 
 
320 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.22 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  41.02 
 
 
359 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  41.02 
 
 
359 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.94 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  40.42 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  44.37 
 
 
314 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  39.1 
 
 
365 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  39.23 
 
 
342 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  38.91 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.24 
 
 
321 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  36.96 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  35.12 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.03 
 
 
331 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  35.57 
 
 
351 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  33.65 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  34.45 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.15 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  25.17 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  25.17 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  25.57 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  30.47 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  25.17 
 
 
308 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.24 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  27.12 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  25.83 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  25.17 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  26.6 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.68 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  18.77 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  30.99 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.9 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  23.58 
 
 
304 aa  67  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.24 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.51 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  35.02 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.92 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  33.19 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  29.39 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1200  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25579  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 
520 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  26.99 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
530 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  25.33 
 
 
306 aa  60.1  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  23.79 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.25 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  29.79 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  28.25 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
298 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.87 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.41 
 
 
293 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.7 
 
 
308 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
303 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.12 
 
 
290 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  27.18 
 
 
308 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  26.21 
 
 
288 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  29.34 
 
 
323 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  30.69 
 
 
302 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  23.89 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 
293 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  21.55 
 
 
304 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  27.5 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
298 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  22.58 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 
289 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3349  hypothetical protein  22.64 
 
 
302 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000303507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 
296 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 
290 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  23.27 
 
 
304 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  25.71 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 
317 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.93 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  29.61 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  22.68 
 
 
309 aa  52  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  24.28 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  29.61 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  29.53 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3418  drug/metabolite exporter family protein  22.96 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000357503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  27.48 
 
 
316 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.48 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.48 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  25.65 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3697  hypothetical protein  22.64 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3369  drug/metabolite exporter family protein  22.64 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00811973  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.74 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 
290 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>