48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1048 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  91.33 
 
 		 323 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  68.23 
 
 		 306 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1166  hypothetical protein  66.89 
 
 		 307 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.533406  normal  0.0102803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3304  hypothetical protein  71.86 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1200  hypothetical protein  66.89 
 
 		 307 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4245  hypothetical protein  66.67 
 
 		 307 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.691144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  39.79 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  26.87 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  29.85 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  30.25 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  29.34 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.8 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  27.69 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.12 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27.62 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  28.23 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.29 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  26.52 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  24.01 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.19 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  26.48 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.09 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  23.77 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.76 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  26.75 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  27.73 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.79 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  27.17 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  27.17 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  26.91 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  37.33 
 
 		 395 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  27.19 
 
 		 316 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  25.16 
 
 		 315 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  26.05 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  28.19 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.07 
 
 		 316 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  27.8 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  34.67 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.18 
 
 		 397 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>