218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1135 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  693    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  99.16 
 
 		 359 aa  687    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  71.26 
 
 		 342 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  69.34 
 
 		 365 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.38 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  43.14 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.85 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  41.14 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.62 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.12 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  40.63 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  42.41 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.83 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  43.59 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  36.25 
 
 		 324 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.22 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.14 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  38.54 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  31.61 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  33.72 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  35.62 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  36.71 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.25 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.55 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  33.45 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  29.62 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  31.15 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  31.15 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.15 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  31.15 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  31.15 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  31.15 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  31.15 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  31.15 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.17 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  31.82 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.8 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  28.52 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  31.4 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.24 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  27.27 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.57 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.61 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.51 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  29.53 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  28.27 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  28.25 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  28.72 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  29.39 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  26.21 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  27.88 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.51 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  24.7 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  28.47 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.33 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  27.17 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  21.34 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  27.27 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  29.92 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  28.21 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.08 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  29.53 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  23.51 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  35.23 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  29.53 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  29.56 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  29.92 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  23.73 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  28.31 
 
 		 278 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.36 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  22.96 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  26.81 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  32 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  27.23 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  24.89 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  32.79 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.49 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.41 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.19 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 301 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  26.77 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  29.2 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  22.44 
 
 		 304 aa  53.1  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.33 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  27.69 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>