96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1407 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
331 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.18 
 
 
348 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  46.77 
 
 
320 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  46.29 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 
341 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  46.77 
 
 
320 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.04 
 
 
331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  42.47 
 
 
359 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  42.47 
 
 
359 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  42.14 
 
 
359 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  39.01 
 
 
342 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  38.72 
 
 
356 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  39.42 
 
 
365 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  47.06 
 
 
295 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  45.82 
 
 
314 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.22 
 
 
328 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  38.05 
 
 
324 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.74 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.85 
 
 
331 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  31.7 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  35.18 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  34.57 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  35.86 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  29.85 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  36.43 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 
309 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.1 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  27.88 
 
 
292 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  29.76 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  27.73 
 
 
323 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  41.38 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  41.38 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  41.38 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  27.42 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2234  hypothetical protein  28.05 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.7 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.33 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  31.56 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1255  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  25.96 
 
 
327 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 
323 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  27.97 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  46.48 
 
 
303 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.99 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  25.64 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.96 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.02 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3210  hypothetical protein  27.74 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  29.92 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  30.72 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.68 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  31.78 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3877  hypothetical protein  27.61 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  28.24 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  30.82 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3236  hypothetical protein  28.77 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  31.44 
 
 
278 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.58 
 
 
297 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  29.76 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 
317 aa  46.6  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  27.87 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.71 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  23.6 
 
 
299 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  29.58 
 
 
314 aa  45.8  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  26.4 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.07 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.59 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  26.38 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.26 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  25.29 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  22.8 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  29.91 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  24.8 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  23.27 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.81 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  27.45 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  27.45 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.18 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.35 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.69 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  32.11 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.19 
 
 
316 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  27 
 
 
288 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  26.8 
 
 
298 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.19 
 
 
300 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 
297 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  26.3 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  31.85 
 
 
358 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  27.44 
 
 
320 aa  42.7  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2739  hypothetical protein  30.82 
 
 
313 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>