More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4896 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 316 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  36.66 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  30.9 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  36.36 
 
 		 351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  34.91 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  34.59 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.59 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.33 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 		 341 aa  92.8  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  31.19 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  35.03 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.7 
 
 		 348 aa  89  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  31.64 
 
 		 359 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  29.97 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  31.34 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.03 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  31.34 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  35.55 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  35.03 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.19 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  32.97 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  27.36 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  30.56 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.68 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  28.4 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.67 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  24.83 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  30.56 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  28.85 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.74 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  28.37 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  28.97 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  28.97 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  28.97 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  28.97 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  28.97 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  28.97 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  28.97 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  30.58 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  31.06 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  29.34 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  26.58 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  25.41 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  28.73 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  27.34 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  26.45 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  31.88 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 520 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  28.63 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.87 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  30.23 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  28.04 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  30.23 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  28.71 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  33.94 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  29.76 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  27.68 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  28.24 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.68 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  29.34 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  27.68 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  24.33 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  27.67 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  27.57 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  31.52 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  28.11 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  28.11 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  27.76 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  27.76 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  25.17 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.22 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.6 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  28.2 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  21.81 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.06 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.87 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.91 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.98 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  22.09 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.06 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>