175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1785 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  100 
 
 		 297 aa  591  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  57.77 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  55.37 
 
 		 304 aa  331  8e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  36.59 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  33.33 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  34.38 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  34.19 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  33.22 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.67 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  32.88 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  32.17 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  31.63 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  32.5 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  30.95 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  32.61 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  32.99 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  30.33 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.1 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.1 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.76 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.1 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  34.11 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  34.11 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  28.76 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.76 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  28.76 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.76 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  29.84 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.39 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.39 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.39 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.39 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.39 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.95 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.76 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  26.09 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  26.51 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  27.24 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  26 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  26.33 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  26 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  26 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  26 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.51 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  31.21 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.17 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  32.31 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  27.51 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  30.77 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  27.21 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  31.63 
 
 		 322 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  31.63 
 
 		 322 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  31.63 
 
 		 322 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  28.11 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  30.95 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  27.4 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 520 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  28.31 
 
 		 358 aa  92  9e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  27.03 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.08 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.84 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.18 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  24.03 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  25.09 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  22.45 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  25.42 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  24.75 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  24.83 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.17 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  24.67 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  24.78 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  28.19 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.83 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  24.57 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  24.57 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.91 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  25.33 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  24.78 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  24.25 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.91 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  23.02 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  23.74 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.34 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  29.69 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  21.88 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  24.01 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  27.13 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.18 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>