153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1617 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  100 
 
 
296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  44.75 
 
 
296 aa  262  4e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.24 
 
 
314 aa  255  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  44.15 
 
 
299 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  44.56 
 
 
300 aa  236  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  37.82 
 
 
297 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
331 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  35.64 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  35.29 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
520 aa  162  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  34.16 
 
 
304 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  32.54 
 
 
299 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 
303 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 
530 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  28.38 
 
 
325 aa  149  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  31.25 
 
 
319 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.56 
 
 
301 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  29.76 
 
 
306 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  29.83 
 
 
308 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.71 
 
 
315 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.71 
 
 
315 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.71 
 
 
315 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.71 
 
 
315 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.71 
 
 
315 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  34.14 
 
 
307 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.14 
 
 
307 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.14 
 
 
307 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  34.14 
 
 
307 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.79 
 
 
307 aa  142  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
313 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.14 
 
 
307 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  30.46 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.79 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.14 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.79 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  31.42 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  32.76 
 
 
304 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  28.47 
 
 
308 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  28.81 
 
 
308 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  28.81 
 
 
308 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  31.79 
 
 
322 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.47 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.14 
 
 
308 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  31.93 
 
 
309 aa  135  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  29.8 
 
 
321 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  28.14 
 
 
308 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  27.8 
 
 
310 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  27.8 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  27.8 
 
 
308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  28.47 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  30.13 
 
 
322 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  30.46 
 
 
322 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  30.46 
 
 
322 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  30.46 
 
 
322 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  30.46 
 
 
322 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  28.81 
 
 
321 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  28.36 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  28.36 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  29.17 
 
 
295 aa  119  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  28.48 
 
 
322 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  27.21 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  28.43 
 
 
304 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  25.42 
 
 
305 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.99 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  34.85 
 
 
150 aa  72  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.31 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  25.6 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  25.89 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  25.7 
 
 
297 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.49 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 
321 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.05 
 
 
309 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.13 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  20.38 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.62 
 
 
301 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  24.91 
 
 
290 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  24.92 
 
 
294 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  22.29 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  25.84 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  22.29 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.92 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.89 
 
 
302 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  24.24 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  25.51 
 
 
279 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  24.24 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  24.24 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.38 
 
 
348 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  24.24 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  25.59 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  25.59 
 
 
305 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  25 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  25 
 
 
295 aa  48.9  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>