138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4226 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  594  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  90 
 
 		 320 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.62 
 
 		 341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.02 
 
 		 348 aa  275  9e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  50.62 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  52.13 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.65 
 
 		 331 aa  218  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  45.6 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  41.69 
 
 		 342 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.08 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  40.63 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  40.63 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  38.02 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  40.32 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.67 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.83 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  45.71 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  34.81 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  35.54 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  35.19 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  32.88 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  33 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.24 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  30.89 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.23 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  28.7 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  25.97 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  24.32 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  23.99 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 530 aa  62.8  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.71 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  33.22 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  21.19 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  22.01 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  22.4 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  25.33 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  28.43 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  24.83 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  24.38 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.69 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  21.36 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  24.05 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  29.05 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.16 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  33.08 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  34.65 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.27 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  25.82 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  25.82 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  25.82 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.45 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  39.81 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  23.47 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  25.82 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  23.43 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.42 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  25.93 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  23.9 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  33.13 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.65 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  22.22 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  22.31 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  22.22 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.75 
 
 		 292 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  21.9 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.22 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  21.9 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.22 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.59 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  30.33 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  29.24 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  22.22 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.17 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  29.52 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  21.79 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.12 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  27.51 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.75 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.12 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  22.54 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  22.54 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  30.6 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0369938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  22.54 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.75 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>