206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1147 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  99.16 
 
 
359 aa  687    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  99.16 
 
 
359 aa  687    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  71.26 
 
 
342 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  69.34 
 
 
365 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.38 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  43.05 
 
 
357 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.53 
 
 
341 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  40.54 
 
 
356 aa  176  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.29 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.38 
 
 
328 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  40.32 
 
 
320 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  41.77 
 
 
320 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.5 
 
 
331 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  43.49 
 
 
314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  35.95 
 
 
324 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.54 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
331 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  38.54 
 
 
295 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  31.61 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  34.02 
 
 
314 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  35.83 
 
 
333 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  37.06 
 
 
322 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 
335 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.88 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  33.45 
 
 
297 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  33.12 
 
 
310 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  30.77 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  30.77 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  30.77 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  30.77 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  30.77 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  30.77 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  30.77 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  30.77 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  31.98 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.16 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.88 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  28.67 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  31.58 
 
 
297 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.89 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  26.95 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  28.77 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
293 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.2 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  30.31 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  28.52 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  27.99 
 
 
305 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  26.97 
 
 
292 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
293 aa  60.1  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  28.1 
 
 
288 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  27.99 
 
 
290 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  26.94 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  27.73 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  28.29 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  29.87 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  28.52 
 
 
278 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.19 
 
 
520 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.81 
 
 
289 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  26.77 
 
 
295 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 
530 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  29.53 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  29.53 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  29.13 
 
 
295 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  29.13 
 
 
295 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  27.64 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.19 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  27.34 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  21.9 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  24.34 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.5 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  26.49 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.38 
 
 
301 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  25.71 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  27.38 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  26.45 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  32 
 
 
309 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  32.37 
 
 
289 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  24.89 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
321 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  35.23 
 
 
305 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  27.69 
 
 
306 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 
280 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
302 aa  52.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  22.93 
 
 
296 aa  53.1  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  24.09 
 
 
299 aa  52.8  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.94 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>