194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5067 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  46.25 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.21 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  44.79 
 
 		 333 aa  205  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  41.42 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  44.7 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 		 335 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  42.76 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  39.31 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.55 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  35.58 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.68 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  35.03 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  33.12 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  34.45 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  33 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  33.77 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  31.64 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.55 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.78 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.09 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  32.12 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  31.76 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  30.67 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  30.28 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  31.27 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  30.18 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  31.12 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  30.52 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  29.82 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  29.2 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  31.72 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  29.03 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.67 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1425  putative integral membrane protein  30.56 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  29.39 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.16 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  27.08 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  29.1 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  30.53 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  27.65 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  28.15 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  28.52 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  24.14 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  29.47 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  29.47 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.62 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  27.24 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  29.47 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  29.47 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  29.47 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  29.47 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  29.12 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.56 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  27.43 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.57 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  26.51 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1557  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  24.83 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.84 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.75 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.79 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  28.31 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  30.42 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  30.42 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  24.83 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  24.83 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  30.42 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  30.42 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  29.82 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  27.37 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.91 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  23.49 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.91 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  21.43 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.91 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  28.11 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.05 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>