72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1854 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  45.58 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  45.92 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.14 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.96 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  40 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.24 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.85 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  39.74 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  39.02 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  39.4 
 
 		 359 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  39.4 
 
 		 359 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  39.2 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  46.23 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  37.02 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.19 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  36.99 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.07 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  36.64 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  33 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  34.54 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  33.61 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  32.4 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  27.19 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.81 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  25.56 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.88 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  23.61 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  22.8 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.71 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  24.52 
 
 		 290 aa  52.4  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.8 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  30.63 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  26.38 
 
 		 316 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  23.75 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  24.68 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0853  hypothetical protein  34.01 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.59 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  32.3 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0859  hypothetical protein  34.01 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.930252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0870  hypothetical protein  34.01 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  24.89 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.86 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  23.57 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  26.67 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.68 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  33.85 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  29.01 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.22 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.19 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2401  hypothetical protein  25.34 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00730365  normal  0.0851342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  19.92 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  26.69 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  29.49 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  41.89 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  23.39 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  31.96 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  24.52 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  23.33 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 		 339 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0746717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>