224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4102 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  672    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  82.07 
 
 		 348 aa  521  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.3 
 
 		 341 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  50.62 
 
 		 320 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  50.48 
 
 		 320 aa  255  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  43.75 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  45.22 
 
 		 342 aa  222  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  43.81 
 
 		 356 aa  218  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.48 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  42.6 
 
 		 359 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  42.6 
 
 		 359 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  42.5 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  47.8 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.29 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.48 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  40.58 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  32.82 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  35.91 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  35.35 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  37.05 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.51 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  38.59 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  33.22 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 335 aa  85.9  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  28.09 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  25.63 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  29.86 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.98 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.69 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.69 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.69 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.69 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 520 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.98 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.18 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  34.27 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  25.32 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.13 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.69 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  33.05 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.78 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  32.39 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  30.29 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  22.73 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.01 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  33.04 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  33.04 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  33.04 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  33.04 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  33.04 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  29.3 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  24.46 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000893438  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  24.1 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.54 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  26.69 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.54 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  26.21 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.21 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.21 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  26.21 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.21 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.21 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  23.64 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.89 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.16 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  26.32 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  23.45 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  31.76 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.84 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  31.8 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.95 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.34 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  24.81 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.73 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 302 aa  53.9  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.02 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  23.83 
 
 		 309 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  29.41 
 
 		 319 aa  53.1  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  26.97 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  23.61 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.5 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  23.69 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>