125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1792 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.69 
 
 		 341 aa  251  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  52.33 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  51.99 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.19 
 
 		 348 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.68 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.55 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  47.29 
 
 		 357 aa  215  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  44.37 
 
 		 356 aa  196  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  44.3 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  42.51 
 
 		 365 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  43.59 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  43.59 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.37 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  43.49 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  46.1 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.82 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  36.09 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.74 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  35.69 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  32.28 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.13 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  35.87 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  30.2 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  32.09 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.1 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  30.73 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  33.18 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  25.62 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  33.14 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.55 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.84 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  34.13 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.3 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  24.07 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.1 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.37 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  23.95 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  34.25 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  25.41 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.65 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  30.74 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  24.86 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  25.15 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.76 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  30.74 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  30.74 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.68 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  31.54 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.18 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.73 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  31.73 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  22.77 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  28.69 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  27.15 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  30.18 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  25.9 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  25.96 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  25.96 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  25.96 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.96 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.72 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  25.96 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  29.11 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  24.18 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.99 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.05 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  25 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  24.22 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.03 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  31.93 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  22.99 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  31.93 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  28.85 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.82 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  32.28 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  24.67 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.98 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  30.22 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  24.91 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  23.73 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.3 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  29.31 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>