157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2244 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  100 
 
 		 297 aa  586  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 		 314 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  40.21 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.79 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  40.14 
 
 		 322 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  39.46 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  41.5 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.07 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.77 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  40.82 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  40 
 
 		 301 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  37.89 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  39.44 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  37.72 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  34.93 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  35.27 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  34.93 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  35.27 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  35.27 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  34.59 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  36.33 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.89 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  37.54 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.54 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  37.54 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.54 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.54 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  34.59 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.19 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  38.25 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.54 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  38.25 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  38.25 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  38.25 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  38.25 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  35.27 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.59 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.54 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  37.5 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.93 
 
 		 308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  40.48 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  41.5 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  39.46 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  39.46 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  39.46 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  39.46 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.94 
 
 		 520 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  34.38 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  34.39 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  36.57 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  36.57 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  34.15 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  34.04 
 
 		 304 aa  161  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 530 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  33.79 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  31.46 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  30.25 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  30.24 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  30.24 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  30.82 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  34.57 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  27.59 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  24.3 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.76 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  26.14 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  26.14 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  26.14 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  26.14 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  26.52 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  25.76 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  25.76 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  25.38 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  25.63 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  25.38 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  24.62 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  25.17 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.6 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.62 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.62 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.62 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  24.82 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  24.62 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.62 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  24.62 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  23.19 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.62 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.62 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.62 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.63 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  27.94 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.62 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.85 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  23.75 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.24 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>