110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  100 
 
 		 319 aa  637    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  48.25 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.41 
 
 		 530 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.72 
 
 		 520 aa  169  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.88 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  32.89 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  35.37 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  31.25 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  32.17 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  31.39 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.91 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.59 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.59 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.59 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.59 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.44 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.12 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  32.8 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.8 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.69 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.8 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  32.8 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.8 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.48 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.15 
 
 		 307 aa  146  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  32.44 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  29.11 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  28.09 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  29.8 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  29.14 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  27.1 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  26.92 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.24 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  27.63 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  28.98 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.63 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  26.64 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  26.64 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  26.64 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.12 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  26.64 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  24.58 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  27.92 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  26.21 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  27.63 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  30.5 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  26.4 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  25.24 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  26.86 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  26.86 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  24.04 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  27.03 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  23.51 
 
 		 322 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24.38 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  23.78 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  23.6 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  22.98 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  22.96 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  22.98 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  22.98 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  22.88 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.84 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  24.44 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.97 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  23.7 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  27.62 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  26.97 
 
 		 150 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  22.71 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  25.09 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  24.21 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  24.76 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  23.81 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  26.1 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  23.32 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  22.7 
 
 		 359 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.13 
 
 		 286 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.52 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  25.96 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.28 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  24.38 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  25.43 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  23.66 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.04 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  22.7 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  22.7 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.04 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.04 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>