214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0979 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  100 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  37.36 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  36.24 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  32.19 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  32.89 
 
 		 297 aa  168  9e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  33.9 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  32.54 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  31.77 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  33.91 
 
 		 295 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  31.01 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  32.87 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.45 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.45 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.45 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  33.1 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.1 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  32.43 
 
 		 322 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.1 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  33.1 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.76 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.1 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.45 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  31.19 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  31.44 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  33.11 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  31.94 
 
 		 304 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  31.76 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  34.98 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  34.98 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  28.24 
 
 		 308 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  28.24 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  28.24 
 
 		 308 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  28.24 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  28.24 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.91 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  27.57 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  30.3 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  27.24 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  28 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 520 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.57 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  31.07 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 		 530 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  31.42 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  29.67 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  30.74 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  30.74 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  30.74 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  30.74 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  27.4 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  27.49 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  26.95 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.41 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  24.05 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  25.5 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  28.75 
 
 		 327 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.82 
 
 		 317 aa  85.5  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.76 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.42 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  28.85 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.16 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  22.7 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  22.71 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  23.48 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  24.08 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.45 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  24.83 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21.89 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  21.27 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  22.69 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.34 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.05 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.65 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.77 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.58 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.12 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.32 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  20.77 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  22.67 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  25.34 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>