160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1569 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  100 
 
 
295 aa  568  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  45.73 
 
 
306 aa  258  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  38.14 
 
 
309 aa  176  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  35.53 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  37.62 
 
 
322 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  37.62 
 
 
322 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 
309 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  37.29 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  39.27 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  34.01 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  33.33 
 
 
308 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  34.01 
 
 
308 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  33.22 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  34.13 
 
 
308 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  33.33 
 
 
308 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  35.44 
 
 
304 aa  162  9e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  33.33 
 
 
308 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  33.33 
 
 
308 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  33.67 
 
 
308 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33.56 
 
 
308 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33.56 
 
 
308 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.48 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  37.95 
 
 
321 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  33.1 
 
 
299 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  33.56 
 
 
300 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  36.96 
 
 
322 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  37.29 
 
 
322 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  37.29 
 
 
322 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  37.29 
 
 
322 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  37.17 
 
 
322 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  35.64 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  35.64 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.78 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.46 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.12 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  34.12 
 
 
307 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.12 
 
 
307 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  34.12 
 
 
307 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.12 
 
 
307 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.78 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.46 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.99 
 
 
301 aa  138  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.13 
 
 
315 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.13 
 
 
315 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.13 
 
 
315 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.13 
 
 
315 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.78 
 
 
315 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
530 aa  133  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  27.4 
 
 
305 aa  132  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  29.15 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  30.18 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 
303 aa  128  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  28.18 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  29.17 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  31.99 
 
 
290 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 
520 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  31.65 
 
 
290 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  26.21 
 
 
319 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  28.42 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  24.19 
 
 
325 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 
331 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  27.72 
 
 
358 aa  102  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 
293 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  26.86 
 
 
304 aa  93.2  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
310 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.83 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.32 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.75 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.75 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.75 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.75 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.75 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.32 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.75 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.75 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.23 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.32 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  26.17 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  26.17 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.9 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  25.1 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  26.83 
 
 
300 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.17 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  25.11 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  29.09 
 
 
150 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.68 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.33 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.57 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 
323 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  29.14 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  27.42 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  25.82 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  24.43 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  23.83 
 
 
324 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  28.44 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  29.1 
 
 
301 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>