195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0884 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  100 
 
 		 299 aa  592  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  69.73 
 
 		 300 aa  422  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  59.25 
 
 		 296 aa  352  4e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.37 
 
 		 314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  44.15 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  38.68 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.9 
 
 		 530 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  37.82 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  40.3 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.46 
 
 		 520 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  35.05 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  34.83 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.74 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.74 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.74 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.74 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.74 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.22 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  32.09 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.87 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.87 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.53 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  32.53 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.98 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  32.53 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.53 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.53 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.18 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 		 331 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  31.06 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  30.85 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  30.85 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  29.97 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  30.85 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.45 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  29.9 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  30.85 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  30.51 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  31.48 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  31.48 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  27.37 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  30.38 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.72 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  29.07 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  32.61 
 
 		 297 aa  135  8e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  30.72 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  29.11 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  27.27 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  29.15 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  27.76 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  30.33 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  27.3 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  28.48 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  27.81 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  24.91 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.8 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.81 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  28.15 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  27.81 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  27.81 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  27.15 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  27.81 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  28.15 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.04 
 
 		 297 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  31.76 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  26.6 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  24.91 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  25.52 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.4 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.56 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  23.55 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  23.89 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  26.98 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  23.04 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.27 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.78 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  26.99 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  21.29 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  22.67 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  21.25 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  21.25 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.26 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.17 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  24.04 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  20.63 
 
 		 309 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  24.77 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  22.41 
 
 		 331 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  21.45 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  24.56 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>