250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0548 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  100 
 
 
306 aa  597  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  45.73 
 
 
295 aa  246  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.37 
 
 
313 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  38.64 
 
 
297 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.38 
 
 
309 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  38.87 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  36.05 
 
 
300 aa  178  9e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  37.91 
 
 
321 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  37.87 
 
 
322 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  34.8 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  34.45 
 
 
308 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  32.19 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  34.9 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  34.56 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.56 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  35.71 
 
 
309 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  34.9 
 
 
308 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  34.46 
 
 
308 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  34.9 
 
 
308 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  36.59 
 
 
297 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  34.78 
 
 
308 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  33.78 
 
 
310 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  39.12 
 
 
322 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  35.35 
 
 
304 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 
303 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  39.2 
 
 
322 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  39.2 
 
 
322 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  39.2 
 
 
322 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  37.06 
 
 
321 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  39.2 
 
 
322 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  35.81 
 
 
322 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  34.78 
 
 
320 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  34.78 
 
 
320 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.18 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.18 
 
 
315 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.18 
 
 
315 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.18 
 
 
315 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.18 
 
 
315 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
530 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.8 
 
 
307 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.8 
 
 
307 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  30.95 
 
 
296 aa  151  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  34.46 
 
 
307 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.46 
 
 
307 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  34.46 
 
 
307 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.46 
 
 
307 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.46 
 
 
307 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  27.97 
 
 
305 aa  149  8e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.46 
 
 
299 aa  149  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.46 
 
 
307 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  28.81 
 
 
300 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  29.76 
 
 
296 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.51 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.03 
 
 
293 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
520 aa  139  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  27.37 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 
321 aa  129  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  26.71 
 
 
290 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  26.71 
 
 
290 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  26.74 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 
331 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  24.58 
 
 
319 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  27.1 
 
 
325 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.3 
 
 
315 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  25.71 
 
 
304 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.25 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  24.71 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  29.6 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.45 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  24.67 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  28.68 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.31 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  21.43 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  25.09 
 
 
288 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.75 
 
 
294 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  25.25 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.21 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.55 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.95 
 
 
341 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  25.97 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.55 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  27.27 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.98 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.2 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.48 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  22.49 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.48 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  26.33 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.68 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  23.75 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  23.65 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  23.16 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.6 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.6 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>