132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0947 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  100 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  98.28 
 
 
290 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  97.87 
 
 
150 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.29 
 
 
314 aa  192  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  35.05 
 
 
299 aa  180  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  37.41 
 
 
300 aa  172  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  35.64 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  35.64 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  35.53 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.64 
 
 
530 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
520 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.87 
 
 
308 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  30.88 
 
 
310 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  29.97 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  29.63 
 
 
308 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.97 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  31.34 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  29.63 
 
 
308 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  29.63 
 
 
308 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  29.25 
 
 
308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  30.18 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  30.18 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.24 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  30.63 
 
 
304 aa  132  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  31.31 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.1 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.39 
 
 
315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.1 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.1 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.1 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.38 
 
 
299 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.03 
 
 
307 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  31.03 
 
 
307 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.74 
 
 
307 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  31.03 
 
 
307 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.03 
 
 
307 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.4 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.4 
 
 
307 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  32.65 
 
 
307 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  27.6 
 
 
322 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  26.71 
 
 
306 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  29.32 
 
 
321 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  27.6 
 
 
322 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  29.14 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  28.1 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  31.31 
 
 
295 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
309 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  29.8 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  27.4 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  28.34 
 
 
321 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  27.6 
 
 
322 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  27.6 
 
 
322 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  27.6 
 
 
322 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  25.62 
 
 
309 aa  109  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  27.4 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  27.6 
 
 
322 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  27.27 
 
 
322 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  27.3 
 
 
358 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 
293 aa  102  7e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  27.05 
 
 
300 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  26.02 
 
 
320 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  26.02 
 
 
320 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.4 
 
 
315 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  24.41 
 
 
305 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  26.45 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.37 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.53 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.7 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  27.49 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  23.99 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  22.45 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  24.08 
 
 
357 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.12 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.64 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.18 
 
 
289 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  22.8 
 
 
320 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 
348 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.14 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  23.05 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  22.22 
 
 
288 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  24.16 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  26.03 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  26.22 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  20.29 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.98 
 
 
300 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  18.6 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25.22 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.05 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  20.29 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  20.29 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>