More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0442 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  583  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.21 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.72 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  35.54 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  35.54 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  35.69 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  35.74 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  35.19 
 
 		 309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  34.84 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  32.14 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  34.84 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  34.84 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  35.49 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  35.14 
 
 		 402 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  31.6 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  29.27 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  31.06 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  34.36 
 
 		 316 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  34.25 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  34.25 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  34.25 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  32.99 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  33.11 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  33.9 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  33.9 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  33.9 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  33.9 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  30.92 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  32 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  30.92 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  31.75 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  27.21 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  26.86 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  28.62 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 309 aa  95.5  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  26.39 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  26.69 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  26.9 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.39 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  29.5 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  30.62 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  27.01 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.03 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.46 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.26 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.08 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  27.93 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.32 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.66 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  28.48 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.26 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  25.37 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.26 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  27.24 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  28.33 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.84 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.48 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.87 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.48 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.9 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  25.57 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  27.98 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.86 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  26.96 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.12 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  26.32 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  26.32 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.7 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.09 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.72 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.14 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.04 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  28.51 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  26.32 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0196  hypothetical protein  24.37 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.32 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  25.61 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.43 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  27.52 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  28.14 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  26.86 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>