122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1833 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
291 aa  560  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0333  hypothetical protein  33.45 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.950508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.35 
 
 
302 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  28.76 
 
 
296 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  29.29 
 
 
303 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  28.78 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  28.11 
 
 
288 aa  89.7  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  28.89 
 
 
303 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  27.18 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  26.44 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  25.19 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  25 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  24.19 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.71 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.1 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  30.62 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  25.94 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.97 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.94 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  24.42 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.46 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.46 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.13 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.67 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.01 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.29 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  25.56 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.1 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.72 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  24.23 
 
 
294 aa  52.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  23.91 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  26.13 
 
 
353 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  25.56 
 
 
290 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  22.6 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0371  hypothetical protein  28.95 
 
 
315 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0749298  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  25.56 
 
 
290 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  25.46 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  23.21 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 
298 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  24.53 
 
 
308 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  24.73 
 
 
301 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
382 aa  49.7  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  26.19 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  25.1 
 
 
283 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.7 
 
 
324 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
278 aa  48.9  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.68 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  22.85 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  26.59 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1646  hypothetical protein  26.55 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  27.22 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  24.14 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  24.52 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  25.81 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  24.71 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  24.73 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 
310 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.67 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  24.06 
 
 
322 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  26.32 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.07 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  22.64 
 
 
310 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 
309 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.72 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  23.85 
 
 
289 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.13 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  23.6 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  22.38 
 
 
315 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  23.48 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  24.36 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 
323 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  24.69 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  27.66 
 
 
219 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  26.47 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  24.22 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  23.22 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.82 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  25.1 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  26.17 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.08 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.98 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.08 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.59 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  24 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.31 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  23.53 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  24.23 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  23.53 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>