61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0791 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  700    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  59.6 
 
 
319 aa  299  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.08 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.99 
 
 
295 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  38.75 
 
 
302 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  35.61 
 
 
316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  34.55 
 
 
337 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  28.22 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  27.87 
 
 
310 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  25.62 
 
 
320 aa  87  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  28.76 
 
 
299 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  24.65 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  28.16 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  29.08 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  29.08 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  30.77 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  28.33 
 
 
311 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.39 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 
321 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 
329 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  26.56 
 
 
299 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  25.25 
 
 
302 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
291 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  28.26 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 
285 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.88 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.57 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.11 
 
 
306 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.8 
 
 
297 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.7 
 
 
325 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  27.55 
 
 
295 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  23.83 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  24.47 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  22.73 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  25.85 
 
 
512 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  25.1 
 
 
301 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.55 
 
 
302 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  23.57 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 
302 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  28.75 
 
 
305 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.63 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  25.63 
 
 
343 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  25.52 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.73 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  29.11 
 
 
314 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  23.55 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  26.51 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  25.21 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  25.9 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  23.64 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.73 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.33 
 
 
296 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  30.45 
 
 
332 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  25.63 
 
 
306 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 
299 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>