More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0302 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  587  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  46.08 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  43.27 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  32.64 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  26.85 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.35 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.29 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.29 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.57 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.94 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.31 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.29 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.57 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24.28 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.29 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  30.42 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  24.37 
 
 		 281 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  31.62 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.99 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.32 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  26.44 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  26.39 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  26.39 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.61 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  26.39 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  27.34 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  28.21 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  27.88 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  23.93 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  25.61 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  24.82 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.94 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  26.6 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  26.2 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.94 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  27.34 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.72 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  25.91 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  23 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  25.91 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  25.91 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  24.83 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  27.88 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  26.41 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  25.45 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  22.1 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  27.1 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  28.03 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.5 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  26.72 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  24.4 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  26.91 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  24.4 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  22.68 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  25.4 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  29 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  28.88 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  25.7 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.27 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  24.66 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.41 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  24.74 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  20.35 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  25.7 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.65 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  26.74 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  24.54 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.41 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  25.37 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  22.43 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27.32 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.2 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  30.74 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  22.81 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  24.35 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  25.98 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  26.47 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  22.81 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.87 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  28.29 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  24.63 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  26.9 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>