More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0409 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  29.08 
 
 
300 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.38 
 
 
302 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  28.72 
 
 
302 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  28.72 
 
 
302 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.47 
 
 
300 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.37 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.33 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  28.62 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  27.27 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  30.25 
 
 
296 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.98 
 
 
313 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  27.01 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  29.1 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  26.33 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  29.07 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  23.81 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  25.18 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  32.14 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  30.26 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  26.59 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  26.35 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  26.35 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  22.79 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  24.75 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  27.41 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  30.15 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  25.81 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 
296 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  21.65 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  27.37 
 
 
307 aa  62.4  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  25.97 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  26.92 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.31 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.52 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  30.68 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  26.26 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  28.25 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  28.74 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  23.81 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  21.84 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  23.66 
 
 
292 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  22.92 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  23.43 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.59 
 
 
293 aa  59.3  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  25.1 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  22.68 
 
 
297 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  21.59 
 
 
293 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.27 
 
 
317 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  23.97 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  26.64 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.34 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  26.87 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0859  integral membrane protein, DUF6  23.38 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.24873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  25.09 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  28.71 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  26.63 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.57 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.59 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  27.66 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  28.07 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  29.57 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.34 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  27.56 
 
 
301 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.81 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  28.07 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  28.09 
 
 
343 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  25.18 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  24.89 
 
 
303 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  28.09 
 
 
343 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  24.11 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.16 
 
 
316 aa  55.8  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  25.93 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  22.71 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  25.23 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  26.03 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  24.82 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  25.62 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  24.65 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  28.09 
 
 
512 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  24.65 
 
 
281 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  24.65 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  26.1 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  33.1 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.97 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.67 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  24.49 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  25.98 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.237981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>