226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0189 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  45.58 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.8 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.6 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.87 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  44.44 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  44.71 
 
 		 306 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  42.76 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  43.79 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  44.37 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  44.95 
 
 		 512 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  44.03 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  46.39 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  42.81 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  42.81 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  42.81 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  44.68 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  44.68 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  47.1 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  45.58 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  43.46 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  41.46 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  42.52 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  47.3 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.14 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  43.42 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  45.91 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  42.18 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  38.51 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  44.91 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.38 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  44.72 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  42.73 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.5 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  34.29 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  34.63 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.75 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.03 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  35.9 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  28.25 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  29.37 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  29.37 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.74 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  29.37 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  29 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.85 
 
 		 289 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.55 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  34.49 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  29.56 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.66 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  22.22 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.26 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.21 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  23.74 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  24.07 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.35 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.21 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.44 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  25.19 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  25.83 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.83 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.17 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  24.57 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  23.92 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.58 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  20.7 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  24.81 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.1 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.31 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  21.4 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  22.37 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  22.37 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  20.91 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  26.32 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  29.89 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.64 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  22.17 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.81 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  29.36 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  25.87 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  27.14 
 
 		 353 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>