150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3484 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  65.28 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  49.83 
 
 		 293 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  49.83 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.48 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  49.13 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  49.48 
 
 		 292 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  48.96 
 
 		 293 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  51.94 
 
 		 297 aa  277  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  49.66 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  49.47 
 
 		 294 aa  270  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  50 
 
 		 298 aa  265  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  49.31 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  49.26 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  52.98 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  49.47 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  49.47 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  34.75 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  55.73 
 
 		 145 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  31.48 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.78 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  31.11 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  28.36 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  30.11 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  30.26 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.62 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  30.63 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  27.18 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  26.55 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  29.74 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  24.92 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  28.46 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  28.46 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  22.92 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.52 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  25.4 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.02 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.69 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24.73 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  24.9 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  24.75 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24.73 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.53 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.15 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  25.17 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  26.89 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.38 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  25.1 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  25.1 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.44 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  23.77 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  22.13 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.85 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  21.43 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25.58 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.87 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.03 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  23.74 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.69 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  24.83 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  26.97 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  25.11 
 
 		 315 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  26.26 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  23.57 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  23.93 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.79 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  26.9 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.15 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  22.01 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  28.87 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.84 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  23.28 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.11 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24.51 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  21.23 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  23.1 
 
 		 298 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.97 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  23.41 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  24.02 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.62 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.68 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.39 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.72 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>