69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2032 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  589  1e-167  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  42.24 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  26.99 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  26.28 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  25.31 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  25.51 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  24.41 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  23.26 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  23.58 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  26.92 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.12 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  25.57 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  22.96 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  23.74 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.63 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  26.96 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  22.76 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  27.15 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.51 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25.76 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  20.65 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  20.93 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  21.58 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  21.57 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.15 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  22.97 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.26 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  24.83 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  22.63 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  22.22 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  20.25 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  25.84 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.41 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0663  integral membrane protein, putative transmembrane transporter  24.71 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  23.78 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.15 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.75 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  23.27 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.42 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  21.17 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  28.12 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  24.58 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.74 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  26.23 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  25.36 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  24.07 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  25.36 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  26.78 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.36 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  22.64 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.5 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.78 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.06 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.06 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  27.5 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  24.02 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  24.06 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  21.29 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  19.57 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>