47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2007 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  82.47 
 
 		 291 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.77 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  73.93 
 
 		 280 aa  394  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  69.9 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  59.6 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.23 
 
 		 294 aa  310  1e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  68.18 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  61.7 
 
 		 305 aa  298  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  29.64 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  28.94 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  26.77 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  27.49 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  30.08 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.27 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  29.85 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.57 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  29.39 
 
 		 281 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  26.24 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.08 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  22.22 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  29.03 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  23.31 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.42 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  35.16 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  30.23 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  28.7 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.83 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.49 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001193  permease  27.54 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  36.99 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  32.46 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04981  hypothetical protein  25.17 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  27.52 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>