40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001193 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001193  permease  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04981  hypothetical protein  69.61 
 
 		 307 aa  401  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0275  hypothetical protein  47.33 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  29.22 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  28.77 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1878  hypothetical protein  29.67 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.293131  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  28.77 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  28.83 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  28.83 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  28.83 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  23.53 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  22.88 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  26.83 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  25.23 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  23 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  26.82 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  24.74 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  23.16 
 
 		 273 aa  52.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  23.34 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  20.56 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  24.15 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  24.88 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.68 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  22.26 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  31.2 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  26.52 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  23.99 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  23.39 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  20.55 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  24.26 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.19 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  22.26 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  24.88 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  23.45 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  26.7 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  23.11 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  23.18 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  22.95 
 
 		 302 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  23.13 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>