68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04981 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04981  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  607  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001193  permease  69.61 
 
 		 307 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0275  hypothetical protein  46.05 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  24.65 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  24.65 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  25.52 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  25.52 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  25.52 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1878  hypothetical protein  28.06 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.293131  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.67 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  23.16 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  23.43 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  23.43 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  23.78 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  22.97 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  20.14 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.7 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  30.37 
 
 		 414 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  23.73 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.99 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  26.09 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  26.51 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3469  hypothetical protein  24.91 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63910  hypothetical protein  20.49 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  24.21 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  20.85 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  24.18 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1600  drug/metabolite exporter (DME) family protein  20.74 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0255  hypothetical protein  20.83 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  22.83 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  21.76 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.39 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 329 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  31.76 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  23.87 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  30.41 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  20.98 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  30.41 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  26.45 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  29.73 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  29.73 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  25.52 
 
 		 333 aa  45.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  29.73 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  25.19 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  29.32 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3467  hypothetical protein  21.83 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  29.32 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1296  hypothetical protein  21.89 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  22.76 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09201  integral membrane protein, DUF6  22.84 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0599232  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  31.08 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  23.29 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2716  hypothetical protein  25.78 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.596336  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  21.95 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  29.32 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  29.32 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  23.63 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  23.38 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  29.32 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  29.32 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  25.17 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  21.89 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  42.4  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>